Os vírus gigantes desempenham um papel na sobrevivência de organismos marinhos de células únicas chamadas proteínas. Isso inclui algas, ameba e sinalizadores que criam o local das redes de frutos do mar. Como essas proteínas criam uma parte importante da cadeia alimentar, esses grandes vírus de DNA geralmente causam vários riscos à saúde pública, incluindo flores nocivas de algas.
Um novo estudo da Escola de Marinha, Cientistas da Marinha, Atmosférica e da Terra pode ajudar a liberar uma ampla variedade de vírus em nossas vias navegáveis e oceanos. Esse conhecimento ajudará melhor os líderes locais se as flores de musgo prejudiciais afetarem sua praia ou se houver outros vírus nas baías, rios ou lagos locais.
Utilizando sistemas de computador com alto eficiência, os pesquisadores identificaram 230 novos vírus no banco de dados metagenômico marítimo disponível ao público e classificaram suas funções.
Publicado na revista Vírus NPJ naturais, Suas invenções incluem a invenção de novos genes de vírus gigantes que não foram conhecidos anteriormente na literatura. Dentro desses genes, foram classificadas 530 novas proteínas funcionais, incluindo nove proteínas envolvidas na fotossíntese. Isso indica que esses vírus podem lidar com seu hospedeiro e fotossíntese durante a infecção.
Mohammed Monrissaman, uma bolsa sexual integrada e uma bolsa de estudos que “podemos prever e gerenciar riscos à saúde humana e flores de musgo prejudiciais na Flórida e como elas interagem com algas e outros microorganismos oceânicos, entendendo a diversidade e o papel dos vírus gigantes no mar”. “Grandes vírus geralmente causam mortes para muitos fitoplâncton até a morte. Eles funcionam como o local dos sistemas sub -marítimos da Web alimentar e fontes de alimentos.
Até recentemente, vírus gigantes não eram frequentemente diagnosticados com métodos científicos. Os pesquisadores fizeram uma ferramenta inovadora Deles (BFerramenta Ioinformatic E.Vírus eucariótico RDo meio ambiente de E.METAGEM NIRIBLEMENTALNOhms), projetado para identificar genes virais gigantes em um banco de dados abrangente de sequência de DNA geral.
“Descobrimos que vírus gigantes contêm genes envolvidos em funções celulares, como metabolismo de carbono e fotossíntese – tradicionalmente encontradas apenas em organismos celulares – Benjamin Minjin, um estudante do estudo da Escola Rosonstel, é um estudante do Departamento de Biologia e Meio Ambiente da Marinha”.
Os professores usaram o Pegasus Supercompute na Universidade de Miami no Prost Institute for Data Science and Computing (IDSC) e processar grandes metagenomas – geralmente viola um gigabase para uma biblioteca – ajuda a reconstruir centenas de bibliotecas sociais.
“Este estudo nos permitiu criar uma estrutura para melhorar as ferramentas atuais para detectar novos vírus que podem ajudar com a capacidade de monitorar a poluição e os patógenos em nossas hidrovias”. O túnel foi adicionado.
A equipe de pesquisa de dados de sequência de DNA baixou dos nove maiores projetos globais de amostra marítima que se espalharam do polo para o poste. Usando Beran, eles recuperaram genes gigantes do vírus dos dados. Os genes são marcados usando bancos de dados funcionais genéticos disponíveis em público para classificar as funções desses vírus. Esses genes são comparados a todos os representantes atuais de vírus disponíveis.
O Plano Beran usado para facilitar esta pesquisa preenche uma lacuna no campo da pesquisa, fornecendo uma fácil identificação e classificar os maiores vírus para ordenar o banco de dados. Beran está disponível para uso e pode ser baixado: https://gitlab.com/benminch1/beren
Publicado na revista em 21 de abril de 2025, intitulado “Expansão gigante global do oceano da diversidade global e funcional” Vírus NPJ naturais. Os autores são Benjamin Minj e Mohammed Monirusaman da Universidade de Miami Marine, atmosférica e ciências da terra.
